내분비 호르몬은 신체의 한 부분에서 합성되어 내분비계를 통하여 다른 곳으로 운반된 후 그곳의 세포나 조직의 기능을 조절하는 생체 신호 전달 물질이다.

우리 생체가 정상으로 유지되려면 이들 내분비계에서 분비되는 호르몬의 양과 시간이 적절히 조절되어야 하고, 또한 대상세포(target cells)도 이들 각각에 대한 수용체가 분포해 있어야하며 세포내 신호전달체계가 잘 운용되어야 한다. 만약 이들 과정 중 한 군데라도 이상이 있다면 갑상선 항진증, 당뇨병 등 우리가 흔히 듣고 보는 여러가지 질병으로 나타난다.

알코올성 췌장염은 췌장에서 분비하는 소화효소는 물론이고 혈당을 조절하는 인슐린의 분비를 비정상화시켜 혈당을 올려 고혈당을 유발하거나 혈당이 떨어져 저혈당이 나타난다. 과량의 알코올을 급히 섭취하였을 경우에는 6∼36시간 이내에 현저한 저혈당을 유발하여 심각한 뇌의 손상을 가져올 수 있다. 왜냐하면 우리의 뇌는 다른 조직과 달리 3대 영양소 중 오직 탄수화물만 영양소로 사용하는데, 영양분인 포도당(탄수화물의 일종)의 공급이 저하되면 뇌의 기능 저하는 물론 영양 결핍으로 뇌세포가 죽을 수도 있기 때문이다. 뇌세포는 죽으면 더 이상 재생이 어렵기 때문에 심각한 문제가 된다.

알코올을 장기 복용하면 남성 호르몬인 테스토스테론의 생합성에 관여하는 효소의 기능을 떨어뜨려, 테스토스테론의 농도를 떨어뜨린다. 뇌에서 분비되어 성호르몬을 자극하는 생식선자극호르몬(gonadotropin)의 농도도 음주에 의해 감소되는데, 이런 현상은 동물실험에서도 잘 증명되고 있다. 결론적으로 장기간의 음주는 성기능이나 성욕을 감퇴시키고, 고환의 크기가 작아지거나 또는 기능이 쇠퇴하여 정자의 생산이 줄어들고 불임증을 유발한다. 많은 경우에 남성 호르몬이 적어짐에 따라 상대적으로 여성 호르몬인 에스트로젠의 농도가 높아져, 턱수염이 없어지고 유방이 커지는 등 심한 '여성화 현상'을 나타내기도 한다.

알코올 음주는 여성 호르몬의 합성, 대사나 조절에도 영향을 미친다. 갱년기 전의 여성이 과음을 하면 월경이 중지되고, 규칙적인 배란이 안된다. 또한 갱년기가 빨리 올 수 있고, 자연 유산할 확률도 높아진다. 이러한 것은 알코올이 직접 난소의 기능을 약화시켜서 나타날 수도 있고, 간접적으로 알코올성 간 췌장의 기능 저하나 영양 결핍에 기인한다고 보고되어 있다.

폐경기 이후의 여성이 음주를 하면 에스트로젠이 더 많이 만들어져 에스트로젠의 농도가 높아진다. 이러한 효과 때문에 임상적인 연구가 이루어지고 있으며, 일주일에 3∼6잔 정도 마시면 장기간 음주에 의한 간질환의 위험없이 심장마비 등 관상동맥계 질환을 예방할 수 있다고 한다. 미국 국립알코올연구소에서는 임산부를 제외한 여성의 경우 하루에 1잔을 적극 권장하고 있다.